隨著系統壓力升高，色譜柱峰形也發生了一定的變化，例如，拖尾，峰分岔，分離度降低等等，這些問題的出現都在提示著你色譜柱受到污染。如果您的系統有在線過濾器和保護住，首先應該排查在校過濾器與保護柱，看看是都有問題，來進行更換或者更新，在我們的日常操作中，當尺寸排阻色譜柱壓力升高10%或者是柱效降低10%的時候應該考慮更換在線過濾器和保護柱；應該在工作結束后使用高比例的有機溶劑進行清洗，這樣可以除掉大部分的污染物；要是有機溶劑不能解決，可以根據樣品行性質以及你了解的污染物性質來選擇清洗的方法，用20倍柱體積的HPLC級溶劑清洗色譜柱，把流動相溫度升到35-55度可以大大地提高清洗效率；還可以考慮尺寸排阻色譜柱進行倒沖，特別是當問題表現為壓力急劇升高，提示有顆粒型物質直接堵塞在色譜柱的入口端篩板處時。操作的時候將色譜柱大街，并且與檢測器斷開。