目前，無機陰離子是較成熟的離子色譜檢測方法，除此之外還有無機陽離子的檢測、有機陰離子和陽離子分析等。隨著離子色譜技術的發展，新的分離技術和分析設備已接連出現，只需很短的時間就可得到陰、陽離子以及樣品組成的全部信息，為民眾生活帶來了安全保障。同時，隨著對環境水質的要求越來越高，離子色譜技術的應用也得到更多的推廣和運用，特別是在一些水質安全情況較嚴重的地區，通過這一技術來分析水質情況，可快速遏制不安全飲水現狀，進而為水質檢測技術升級提供基礎。

　　在離子色譜產生初期，重要的應用是對環境樣品的分析。包括環境樣品中各種陰、陽離子的定性、定量分析。例如Cl- 、NO2-、Br- 、NO3-、PO43-、SO42-等陰離子和Li+ 、Na+ 、NH4+、K+、Mg2+ 、Ca2+ 等陽離子的測定。目前，我國各級環境監測部門已廣泛將離子色譜法用于酸雨及濕沉降的測定。較其他方法，離子色譜法分析空氣污染物樣品中的陰、陽離子更簡單、準確。

　　另外，隨著離子色譜儀的不斷完善，其在環境領域中的應用范圍在逐漸擴大。除了分析常見陰，陽離子外，過渡金屬、極性有機物等污染物的分析測定也有大量數據報道。有專業人士綜述了近年來離子色譜在環境分析領域中的新式應用狀況。并對離子色譜在大氣、水、土壤、植物和沉積物等環境樣品中的應用及樣品前處理作了講解。據介紹，離子色譜對某些特定污染物價態分析中也具有突出的優點。

　　在食品安全檢測中，離子色譜法同樣有其不可替代的分析作用。它能分離很多化學性質相似的組份，又是測定糖類的一種靈敏、快速、準確的新方法。目前在食品分析領域，離子色譜分析對象多集中在陰離子方面。隨著脈沖積分安培檢測技術的完善以及分離柱的使用，被多應用于生物化學中糖類、氨基酸、纖維素、抗生素的有關物質檢查、蛋白質和多肽等大分子量化合物的分析。

　　值得一提的是，離子色譜法在我國食品安全檢測領域還有很大的研究空間。檢測技術的不斷改進，必將使離子色譜技術在食品分析領域發揮日益重要的作用。隨著聯用技術的發展，在檢測保健食品中非法添加的化學藥物、食品中的微量殘留的有害物質、非法添加的有害添加劑等檢測領域有望取得更大突破。