來自于色譜系統的污染主要指，HPLC儀器系統中部件磨損而產生的固體顆粒，以及流動相系統過濾不*殘留的固體顆粒。來自于樣品的污染主要指，未*溶解的樣品或者已*溶解的樣品進入色譜系統中，由于樣品溶劑和流動相溶劑對樣品溶解存在的溶解度差異，導致沉淀析出污染系統。

特別是對于中藥、天然產物、合成中間體及生物藥品的檢測，因基質的復雜性，色譜柱受污染的情況會更加嚴重。污染會導致色譜系統壓力升高、色譜柱塌陷、填料變色等，從而帶來檢測成本高，測試結果不準確等各種影響。

保護柱是液相色譜分析中重要的色譜耗材，使用保護柱可大大降低分析柱受污染的程度，延長分析柱使用壽命。

離子色譜柱保護柱位于進樣器與分析柱之間， 作用主要兩方面：

1. 截留不溶性顆粒

2. 吸附樣品基質中的雜質

一、如何選擇保護柱？

1. 保護柱的填料，與分析柱保持一致，填料品牌一致，才能100%確保選擇性一致。

2.保護柱的規格，要與分析柱匹配，填料粒徑一致，保護柱的內徑與分析柱的內徑相近。

3.對于精細分離，保護柱本身的裝填柱效要足夠好。

4.對于精細分離或者小內徑色譜柱分離，保護柱的連接死體積要盡可能小。

5.如果是用于UHPLC柱，還要考慮保護柱的耐壓能力。

保護柱不理想，就會導致峰擴散，分離度下降，不利于精細分離。

理想的保護柱，即使分析柱短小如4.6×100mm，安裝保護柱后也未引起分離度與峰高的降低。

二、如何使用保護柱？

1.專柱。避免保護柱成為不同項目的交叉污染源。

2.及時更換保護柱。當峰的理論塔板數下降15%，或是柱壓上升15%，或是關鍵分離度下降15%時，都應該及時更換保護柱。

3.不慎發生強污染時，可以將分析柱卸下，單獨沖洗保護柱，可以使污染物更快的從保護柱中流出。——但是不可以超聲保護柱。