磺酸基陽離子交換固定相是一種常見的陽離子交換固定相，離子交換功能基為苯磺酸，通常將其健合在有機聚合物基質（如苯乙烯-乙基乙烯苯）或硅膠基質上，前者耐酸堿，常用于離子色譜法分析無機陽離子，后者機械性強，常用于普通HPLC分析有機化合物陽離子。

　　以硅膠為基質的磺酸基陽離子交換固定相簡稱為SCX,功能基團為大多為苯磺酸。目前市面上有多種品牌，pH適用范圍一般為2~8，磺酸基均以離子型存在，為強陰陽離子交換色譜柱。本文主要探討組分在SCX柱上的保留行為。

　　基于疏水作用的色譜行為

　　SCX固定相除磺酸基陽離子交換位點外，還有苯基這一疏水作用位點，其保留作用類似于苯基固定相，主要是疏水作用和與含雙鍵組分的π-π相互作用。

　　甲苯在SCX柱上的保留行為。甲苯作為一種電中性的強疏水性化合物，與固定相之間不存在離子交換作用，也不存在與極性磺酸基團間的親水相互作用，甲苯的保留，可以視為與固定相上苯基相互作用的結果，其保留隨著流動相中有機相比例增大而減小，也與疏水作用色譜原理吻合。

　　對于疏水性強的陽離子化合物，該疏水作用會成為組分保留的一種重要的方式之一，有時這種作用甚至會強于離子交換作用。

　　陰陽離子交換色譜柱既有聚合物基質色譜柱也有硅膠基質色譜柱。然而，不像在反相的領域硅膠柱占絕大部分占有率，離子交換模式中聚合物色譜柱和硅膠色譜柱使用頻率相近。陰陽離子交換色譜柱在蛋白質，核酸等生物化學領域被廣泛利用。絕大多數重組蛋白純化都要用到離子交換。離子交換色譜的基礎是高分辨率，可以直接放大規模應用在工業上，柱再生容易，還可以使蛋白濃縮。