離子色譜儀的工作過程是: 輸液泵將流動相以穩定的流速( 或壓力) 輸送至分析體系, 在色譜柱之前通過進樣器將樣品導入, 流動相將樣品帶入色譜柱, 在色譜柱中各組分被分離, 并依次隨流動相流至檢測器, 抑制型離子色譜則在電導檢測器之前增加一個抑制系統, 即用另一個高壓輸液泵將再生液輸送到抑制器, 在抑制器中, 流動相的背景電導被降低, 然后將流出物導入電導檢測池, 檢測到的信號送至數據系統記錄、處理或保存。

　　離子色譜儀使用的注意事項：

　　1、淋洗液一定是當天配制當天使用。

　　2、啟動泵之前一定要檢查淋洗液儲液瓶至高壓平流泵之間的管路是否充滿液體，以免抽入空氣。

　　3、按照要求需每周開機一次，保證零配件始終處于濕潤狀態（抑制器電流設為零）。

　　4、機器長時間不用時，一旦開機要檢測樣品時，一定要在未加電流的情況下運行1-2天（抑制器電流設為零）。

　　5、抑制器電流一定在開機后20-30分鐘后抑制器出口有液體及氣泡時才能加電流，以免燒壞抑制器。

　　6、分析樣品時，為了保護分離柱，一定要對樣品進行前處理，基本的做法是，過預處理柱，吸附有機物，過濾膜，除去雜質。

　　7、濃度高的樣品還要酌情進行稀釋。