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文/Tosoh Bioscience應用科學家Heidi Vitrac, Ph.D.
前言
新冠疫情把病毒變成了每個人共同的一段切身經歷,盡管如此,我們仍需記住,并非所有的病毒都是危險的。事實上,一些病毒能夠起到輸送生物治療劑的作用。在進行基因治療時常會用到這項技術,可以通過修改患者基因達到治療或治愈疾病的效果。基因治療主要分為以下幾種方式:通過專業技術人員實現正常基因的拷貝與致病基因的替換,使功能異常基因失活,或向體內引入新基因或修飾基因。
選擇方案三時,病毒載體——特別是使用AAV的病毒載體,可以說是極為有用。首先,由于其固有的自然設計,病毒載體進入細胞的效率非常高。其次,該病毒載體的復制需依賴于與其他病毒的共感染,這點使其不具有致病性。最后,至少有12種不同人血清型AAV,其各自感染的細胞類型不同,使其可用于靶向特定類型細胞的治療。
AAV載體是由蛋白質和DNA組成的有著精確構造的復雜生物分子組合。理想情況下,科學家可以造出含預期單鏈DNA的細胞衣殼。但是,系統存在產生無任何DNA的空衣殼及部分填充的衣殼的風險,這些不良衣殼可能會導致治療無效或療效降低。因此,開發生產及測量AAV衣殼的可靠方法
是非常需要的,包括但不限于測量DNA屬性(如基因組完整性、AAV DNA修飾和衣殼中存在的部分DNA)以及衣殼自身屬性(如衣殼的特性、病毒蛋白占比、聚集體等)。這正是SEC和MALS可以發揮作用的地方,特別是在給藥試驗中基因組滴度測定及聚集體或空殼、部分和完整AAV測定方面。
SEC-MALS的威力
要了解SEC-MALS法的威力,首先要了解光散射分析的優勢和過程。光束照射到溶液中的分子時,分子內會產生振蕩偶極子,此時光會向各個方向重新射出。一般來說,光的射出量與分子量有關;但是,散射光的強度隨其散射方向不同而有所差異。為了收集到非常精確的分子測量數據,應從多個不同角度來測量散射光。
東曹生命科學的LenS3 MALS檢測器從極小角度(10度)、極大角度(170度)和直角,三角度散射光檢測模式,來計算分子大小。根據分子是大還是小,可以調用不同的角度。檢測器單次運行即可獲得三個關鍵質量屬性的量化數據:顆粒濃度、衣殼含量和聚集度。典型的儀器配置如圖1所示。事實上,該方法的主要優勢是其所需的系統改造最小也很簡單。
分析高分子量的AAV時,首先必須選擇合適的東曹TSKgel® SEC色譜柱才能獲得分析和鑒定各種雜質所需的合適分離度(圖2)。
然后,可以根據具體分析和需求進行深入優化或微調。最后,SEC-MALS從三個方面為AAV表征提供最有力的方法支持:使用LenS3實現超高靈敏度,測定完整/空殼比率時的增強準確度,及測定AAV聚集體和雜質的能力。
靈敏度和準確度
總的來說,相較于傳統UV檢測,LenS3檢測的靈敏度優勢明顯(圖3)。與UV260和UV280檢測相比,MALS法的靈敏度明顯更高,特別是檢測AAV時,由于這些病毒的分子量相當大,因此其后續在MALS中的光散射信號響應十分強。事實上,如果所選的色譜柱適當,即使濃度極低,如每毫米粒子數僅為4×109,也可以使用MALS實現檢測。另外,研究表明,直角光散射(RALS)信號和衣殼含量在較大的濃度范圍內呈明顯的線性相關,這為顆粒定量測定置信度提供了保證。
制備AAV時一般會產生三類衣殼:空衣殼(不含單鏈DNA)、部分衣殼(含完整長度基因組DNA的片段)和完整衣殼(含所需基因組材料的完整長度)。由于所需產品是完整的AAV衣殼,因此測定完整/空衣殼占比是一個關鍵的質量屬性要求。目前,SEC-MALS法尚且無法區分完整衣殼和部分衣殼,僅可區分完整衣殼和空衣殼。
好消息是,同樣的SEC-MALS法測定分子量的能力十分強大,也可用于測定AAV衣殼的DNA含量。如圖4所示,將RALS信號強度與預期百分比數據進行比較,研究人員發現RALS信號與衣殼DNA含量之間呈明顯的線性相關。簡而言之,該方法能夠精準預測分子量,將制劑中空衣殼含量降低至2%左右。
SEC-MALS法的靈敏度、準確度和精密度明顯優于280 nm和260 nm的UV檢測法,這要歸功于科學家能夠制備出更高密度完整衣殼混合物樣品,從而產生更強的信號響應。
利用MALS還可以最大限度地降低測定DNA時的不準確度。隨著細胞內DNA含量的增加,細胞本身變得更加堅實,細胞內能量減少的檢測也變得更加容易。這些附加數據的獲取能夠增加測定完整/空衣殼比率的置信度。本質上講,SEC-MALS法更容易識別蛋白質的聚集體和片段,同樣歸功于LenS3檢測器具有出色的靈敏度。
未來應用
AAV下游工藝的主要挑戰之一是有效分離所需的完整AAV與純化后的殘留雜質。如果將SEC-MALS法用于未純化樣品,能否應對這一挑戰?
結果顯示,大部分雜質可通過較高的UV響應(如:UV@280 nm,16分鐘內)檢測出來。但UV檢測法對于完整的AAV并不適用。事實上,由于密度問題,14.5分鐘左右時仍未檢測到AAV衣殼的UV信號。這也是SEC-MALS法發揮作用的地方,它能夠檢測和定量具有復雜基質的樣品。簡而言之,SEC-MALS法為分析各種血清型的AAV提供了高靈敏度、穩健的工具。這一論斷對生產和質量控制兩個階段都適用。
SEC-MALS也可用于分析AAV以外的其他病毒。科學家總能想出新的基因遞送策略,東曹生命科學也總有相應策略與之應對。對小病毒顆粒研究得出了與AAV的試驗相似的結果,并實現了高效分離。東曹生命科學對這些病毒顆粒進行了高效分離和分子量測定,通過質量單位與能量換算得出12.8納米的結果——與該病毒顆粒的報告值匹配。簡而言之,SEC-MALS法不僅可應用于AAV,也為其他各種應用創造了無限可能。
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