離子色譜儀的使用具有很高的交聯度和較低的交換容量，進樣體積很小，用柱塞泵輸送淋洗液通常對淋出液進行在線自動連續電導檢測。主要用于環境樣品的分析，包括地面水、飲用水、雨水、生活污水和工業廢水、酸沉降物和大氣顆粒物等樣品中的陰、陽離子，與微電子工業有關的水和試劑中痕量雜質的分析。
離子色譜儀運作前準備：
1、確認淋洗液和再生液的儲量是否滿足需要；
2、將壓縮氣瓶的輸出壓力調節至0.2Mpa，淋洗液瓶的壓力調節至5psi；
3、打開ICS-90后面板的電源開關。接通電源后，ICS-90的泵處于OFF狀態，進樣閥處于LOAD狀態，DS5顯示當前讀數；
4、進入HPLC控制界面主菜單，點擊manual，進入手動菜單。
5、有一段時間沒用，或者換了新的流動相，需要先沖洗泵和進樣閥。沖洗泵，直接在泵的出水口，用針頭抽取。沖洗進樣閥，需要在manual菜單下，先點擊purge，再點擊start，沖洗時速度不要超過10ml/min。
6、調節流量，初次使用新的流動相，可以先試一下壓力，流速越大，壓力越大，一般不要超過2000。點擊injure，選用合適的流速，點擊on，走基線，觀察基線的情況。
7、設計走樣方法。點擊file，選取selectusersandmethods，可以選取現有的各種走樣方法。若需建立一個新的方法，點擊newmethod。選取需要的配件，包括進樣閥，泵，檢測器等，根據需要而不同。選完后，點擊protocol。一個完整的走樣方法需要包括：
a.進樣前的穩流，一般2-5分鐘；
b.基線歸零；
c.進樣閥的loading-inject轉換；
d.走樣時間，隨不同的樣品而不同。
8、進樣和進樣后操作。選定走樣方法，點擊start。進樣，所有的樣品均需過濾。方法走完后，點擊postrun，可記錄數據和做標記等。全部樣品走完后，再用上面的方法走一段基線，洗掉剩余物。
9、關機時，先關計算機，再關液相色譜。
離子色譜儀注意事項及維護
1、未經培訓不能私自上機操作。
2、檢查廢液桶的含量并及時倒空。
3、檢查各組件連接處有無泄漏并及時清洗。
4、對于含有高濃度干擾基體的樣品，進樣前要用0.45um 的過慮膜過慮；再用C 柱過慮。
5、檢查泵頭與泵體連接處有無泄漏。正常操作造成的磨損會導致柱塞密封圈的泄漏，嚴重時可能污染泵的內部，影響正常操作。
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